O Programa de Incubação IERA consiste numa matriz comum de acções, espaços e equipamentos, serviços base e serviços de capacitação, comum a todos os Polos IERA, com o objetivo de apoiar a incubação de ideias de negócio e empresas. Está dividido em quatro fases, com a duração máxima de 150 semanas (3 anos), sendo a primeira de pré-incubação e as restantes de incubação.
